Revolucionando la Anatomía 3D con el Modelo Open-Source de GitHub

El uso de tecnologías de imagen 3D en las ciencias biológicas está generando enormes cantidades de datos anatómicos, pero existen barreras significativas que impiden que estos datos alcancen su máximo potencial. Aunque compartir escaneos en bruto como CT y MRI es común, la distribución de los modelos segmentados, donde las estructuras anatómicas están etiquetadas con precisión, sigue siendo un proceso difícil y poco frecuente. Los repositorios actuales funcionan principalmente como archivos estáticos, sin mecanismos para el refinamiento, la corrección de errores o la curación impulsada por la comunidad.

Para solucionar este problema, el estudio presenta MorphoDepot, un nuevo marco de trabajo que adapta el modelo de desarrollo de software de código abierto, conocido como "fork-and-contribute" y popularizado por plataformas como GitHub, para la gestión colaborativa de datos morfológicos en 3D. Este enfoque permite a investigadores, educadores y estudiantes copiar un conjunto de datos anatómicos, trabajar en él de forma independiente para realizar mejoras o correcciones y, posteriormente, proponer que sus cambios se incorporen al proyecto principal. Esto transforma los conjuntos de datos de recursos estáticos a proyectos dinámicos y curados por la comunidad.

Este sistema no solo facilita la colaboración distribuida y el seguimiento transparente de cada contribución, sino que también fomenta la creación de datos estandarizados y de alta calidad, esenciales para el entrenamiento de modelos de inteligencia artificial. Al integrar el control de versiones de Git y la infraestructura colaborativa de GitHub con la plataforma de visualización 3D Slicer, MorphoDepot crea nuevas y poderosas oportunidades para el aprendizaje a distancia y la ciencia colaborativa, convirtiendo los modelos anatómicos en proyectos vivos que evolucionan gracias al esfuerzo colectivo.


Link al paper: https://arxiv.org/pdf/2601.00030


Autores del estudio: A. Murat Maga, Steve Pieper, Cassandra Donatelli, Paul M Gignac, Matthew Kolmann, Christopher Noto, Adam Summers, Natalie Taft


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