Популярное

Музыка Кино и Анимация Автомобили Животные Спорт Путешествия Игры Юмор

Интересные видео

2025 Сериалы Трейлеры Новости Как сделать Видеоуроки Diy своими руками

Топ запросов

смотреть а4 schoolboy runaway турецкий сериал смотреть мультфильмы эдисон
dTub
Скачать

Download FASTQ Files from NCBI SRA | RNA-Seq Data Retrieval Step-by-Step | Ep. 30

Автор: Bioinfocamp

Загружено: 2025-06-10

Просмотров: 9

Описание:

Welcome to Lecture 30 of the Bioinformatics Data Analysis using Linux, Python & R series!
In this video, we’ll show you how to download raw FASTQ reads for RNA-Seq analysis directly from the NCBI Sequence Read Archive (SRA) using the SRA Toolkit.

🔍 What You’ll Learn:
What is NCBI SRA and how it stores RNA-Seq data

How to search and select datasets using accession numbers

Installing and setting up the SRA Toolkit

Using prefetch and fasterq-dump to download reads

Folder structure and best practices for organizing FASTQ files

Troubleshooting common errors (proxy, download size, disk space)

This tutorial is ideal for beginners who want to practice RNA-Seq on public data from NCBI, GEO, or SRA.

📂 Code & commands from the video: https://bioinfocamp.co
📺 Watch the full playlist here: [Series Playlist Link]
💬 Got stuck using SRA Toolkit? Ask below or join our support group: [Discord/FB Group Link]

👍 Like | 💬 Comment your favorite SRA project | 🔔 Subscribe for full RNA-Seq analysis tutorials

#sra
#ncbi
#fastq
#rnaseq
#bioinformatics
#ngsdata
#linuxpythonr
#srakit
#computationalbiology
#transcriptomics

Download FASTQ Files from NCBI SRA | RNA-Seq Data Retrieval Step-by-Step | Ep. 30

Поделиться в:

Доступные форматы для скачивания:

Скачать видео mp4

  • Информация по загрузке:

Скачать аудио mp3

Похожие видео

array(10) { [0]=> object(stdClass)#4690 (5) { ["video_id"]=> int(9999999) ["related_video_id"]=> string(11) "ek7fx4AJouM" ["related_video_title"]=> string(72) "RNA-Seq Data Analysis in R | Gene Expression Workflow Explained | Ep. 29" ["posted_time"]=> string(21) "9 дней назад" ["channelName"]=> string(11) "Bioinfocamp" } [1]=> object(stdClass)#4663 (5) { ["video_id"]=> int(9999999) ["related_video_id"]=> string(11) "hFcEVM0moYU" ["related_video_title"]=> string(58) "Как Путин видит окончание войны" ["posted_time"]=> string(23) "8 часов назад" ["channelName"]=> string(27) "Анатолий Шарий" } [2]=> object(stdClass)#4688 (5) { ["video_id"]=> int(9999999) ["related_video_id"]=> string(11) "adcijRTI_8E" ["related_video_title"]=> string(81) "Разжёванный курс по Linux для чайников. Часть 1" ["posted_time"]=> string(21) "2 года назад" ["channelName"]=> string(13) "Hacker School" } [3]=> object(stdClass)#4695 (5) { ["video_id"]=> int(9999999) ["related_video_id"]=> string(11) "QvjLJA-qpYQ" ["related_video_title"]=> string(101) "🤖 Machine Learning in Bioinformatics using Python | Classification, Clustering & More | Ep. 18" ["posted_time"]=> string(25) "2 недели назад" ["channelName"]=> string(11) "Bioinfocamp" } [4]=> object(stdClass)#4674 (5) { ["video_id"]=> int(9999999) ["related_video_id"]=> string(11) "IgLGiJ00a1I" ["related_video_title"]=> string(151) "Проброс портов, брутфорс wordpress и jenkins! Прохожу машину Internal на TryHackMe, уровень тяжелый!" ["posted_time"]=> string(25) "2 месяца назад" ["channelName"]=> string(14) "Mister Exploit" } [5]=> object(stdClass)#4692 (5) { ["video_id"]=> int(9999999) ["related_video_id"]=> string(11) "B1ULvYY-0Uo" ["related_video_title"]=> string(124) "Закон сохранения энергии — величайшее заблуждение физики [Veritasium]" ["posted_time"]=> string(24) "11 часов назад" ["channelName"]=> string(10) "Vert Dider" } [6]=> object(stdClass)#4687 (5) { ["video_id"]=> int(9999999) ["related_video_id"]=> string(11) "KFgwXXWT7sQ" ["related_video_title"]=> string(170) "ИИ-агенты — вот что действительно изменит разработку. Пишем ИИ-агент на Python, LangChain и GigaChat" ["posted_time"]=> string(23) "1 месяц назад" ["channelName"]=> string(29) "Диджитализируй!" } [7]=> object(stdClass)#4697 (5) { ["video_id"]=> int(9999999) ["related_video_id"]=> string(11) "v9_Ab2zSND4" ["related_video_title"]=> string(70) "Install R and RStudio for Bioinformatics | Step-by-Step Guide | Ep. 20" ["posted_time"]=> string(22) "13 дней назад" ["channelName"]=> string(11) "Bioinfocamp" } [8]=> object(stdClass)#4673 (5) { ["video_id"]=> int(9999999) ["related_video_id"]=> string(11) "kPZbEgyriYc" ["related_video_title"]=> string(73) "Обучение Linux. От новичка до профи. Часть 1" ["posted_time"]=> string(21) "2 года назад" ["channelName"]=> string(5) "Pulse" } [9]=> object(stdClass)#4691 (5) { ["video_id"]=> int(9999999) ["related_video_id"]=> string(11) "blWdjRUPP6E" ["related_video_title"]=> string(72) "Разведчик о том, как использовать людей" ["posted_time"]=> string(25) "2 недели назад" ["channelName"]=> string(18) "Коллектив" } }
RNA-Seq Data Analysis in R | Gene Expression Workflow Explained | Ep. 29

RNA-Seq Data Analysis in R | Gene Expression Workflow Explained | Ep. 29

Как Путин видит окончание войны

Как Путин видит окончание войны

Разжёванный курс по Linux для чайников.  Часть 1

Разжёванный курс по Linux для чайников. Часть 1

🤖 Machine Learning in Bioinformatics using Python | Classification, Clustering & More | Ep. 18

🤖 Machine Learning in Bioinformatics using Python | Classification, Clustering & More | Ep. 18

Проброс портов, брутфорс wordpress и jenkins! Прохожу машину Internal на TryHackMe, уровень тяжелый!

Проброс портов, брутфорс wordpress и jenkins! Прохожу машину Internal на TryHackMe, уровень тяжелый!

Закон сохранения энергии — величайшее заблуждение физики [Veritasium]

Закон сохранения энергии — величайшее заблуждение физики [Veritasium]

ИИ-агенты — вот что действительно изменит разработку. Пишем ИИ-агент на Python, LangChain и GigaChat

ИИ-агенты — вот что действительно изменит разработку. Пишем ИИ-агент на Python, LangChain и GigaChat

Install R and RStudio for Bioinformatics | Step-by-Step Guide | Ep. 20

Install R and RStudio for Bioinformatics | Step-by-Step Guide | Ep. 20

Обучение Linux. От новичка до профи. Часть 1

Обучение Linux. От новичка до профи. Часть 1

Разведчик о том, как использовать людей

Разведчик о том, как использовать людей

© 2025 dtub. Все права защищены.



  • Контакты
  • О нас
  • Политика конфиденциальности



Контакты для правообладателей: [email protected]