Как интерпретировать тепловую карту для анализа дифференциальной экспрессии генов — простое объяс...
Автор: Biostatsquid
Загружено: 2023-04-12
Просмотров: 42038
В этом видео я расскажу, как интерпретировать тепловую карту для анализа дифференциальной экспрессии генов.
Узнайте, почему тепловые карты — отличный инструмент визуализации результатов анализа DEG или обогащения набора генов, почему кластерные тепловые карты помогают нам находить закономерности в генах и/или образцах, и как интерпретировать тепловую карту на примере реальной публикации!
Мы разберём тепловые карты с самых основ, а затем применим основные положения для интерпретации тепловой карты из научной статьи.
Надеюсь, вам понравится!
--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
Уже смотрели?
Если вам понравилось это видео или оно было полезным, пожалуйста, дайте мне знать! Мы будем очень рады вашим комментариям и отзывам😊
Если у вас есть вопросы, не стесняйтесь оставлять комментарии ниже, я отвечу как можно скорее :)
----------------------------------------------------------------------------------------------------
Вы увлекаетесь биостатистикой и вычислительным анализом? Больше инструментов и ресурсов для биостатистики вы найдете на сайте:
https://biostatsquid.com/
Подпишитесь на меня в Instagram: @biostatsquid:
/ biostatsquid
Чтобы узнать больше:
• простые и понятные объяснения методов биостатистики
• инструменты вычислительной биологии
• простые пошаговые руководства на R и Python
для анализа и визуализации биологических данных!
Не забудьте подписаться, чтобы не пропустить мои видео! --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
Другие интересные ресурсы по тепловым картам:
Дополнительные слайды и советы по созданию тепловых карт: https://acikders.ankara.edu.tr/plugin...
Не хотите программировать? Вы можете легко создавать готовые к публикации тепловые карты с помощью приложения RShiny:
http://shinyheatmap.com/
Или, если вы хотите программировать самостоятельно, рекомендую пакеты pheatmap (планирую скоро выпустить обучающее руководство, но у Дэйва Танга есть отличное пошаговое руководство!):
https://davetang.org/muse/2018/05/15/...
https://bioconductor.org/packages/rel...
Доступные форматы для скачивания:
Скачать видео mp4
-
Информация по загрузке: