Новости об Омикроне: домашние мыши как источник варианта

Последние новости об Омикроне: мыши могут быть источником появления этого и других вариантов коронавируса.
https://www.sciencedirect.com/science...
Ролик о том, как замедлить старение:
   • Остановить старение: контроль эпигенетичес...  
Содержание:
00:00 новость: Омикрон мутировал в мышах
00:29 исследование происхождения нового варианта
02:52 автор о зоонозном резервуаре коронавируса
04:22 мое мнение
Быстрое накопление мутаций в варианте SARS-CoV-2 Omicron вызывает вопросы относительно того, произошло ли его проксимальное происхождение от человека или другого млекопитающего.
Новости об Омикроне: институт генетики и биологии развития при Китайской академии наук приводит убедительные аргументы в пользу появления Омикрона от домашних мышей.
Суть исследования
Авторы идентифицировали 45 точечных мутаций, которые Omicron приобрел после расхождения с линией B.1.1. Ониобнаружили, что последовательность шиповидного белка Omicron подверглась более сильному положительному отбору, чем последовательность любых зарегистрированных вариантов SARS-CoV-2 у человека. Авторы, не удовлетворившись доминирующей на сегодняшний день версией о ВИЧ инфицированном, решили проверить логичное в данном случае предположение о животном происхождении Омикрона.
Оказалось, что спектр изменений генома нового варианта очень похож на эволюцию вируса в клеточных средах мышей. Кроме того, мутации в шиповом белке существенно совпадают с мутациями SARS-CoV-2, которые способствуют адаптации к клеткам мышей-хозяев, в частности, за счет повышенной аффинности связывания шипового белка с рецептором входа.
В совокупности полученные результаты предполагают, что прародитель Омикрона перескочил с людей на мышей, быстро накопил там мутации, способствующие заражению этого хозяина, а затем перескочил обратно на людей, что указывает на межвидовую эволюционную траекторию вспышки Омикрона.
Ход исследования
В этом исследовании мы использовали молекулярный спектр мутаций варианта SARS-CoV-2 Omicron, чтобы проследить его происхождение от ближайшего хозяина. Мы обнаружили, что молекулярный спектр мутаций Омикрона перед вспышкой не соответствовал быстрому накоплению мутаций у людей, а скорее предполагал траекторию, по которой предшественник Омикрона испытал обратное зоонозное событие от людей к мышам где-то во время пандемии (наиболее вероятно). в середине 2020 года) и накапливал мутации у мыши-хозяина более года, прежде чем вернуться к людям в конце 2021 года. Во время эволюции у мышей предшественник Omicron адаптировался к мыши-хозяину, приобретая аминокислотные мутации в шиповидном белке, которые увеличивали его аффинность связывания с мышиным ACE2. Кроме того, накапливались мутации, связанные с ускользанием от иммунного ответа.
Авторы указывают на то, что варианты SARS-CoV-2 человека, о которых сообщалось на сегодняшний день, не могут обеспечить основу для Omicron.
Мнение авторов
Прогнозы, основанные на молекулярном докинге, показали, что адаптация Omicron к мышам также способствовала его адаптации к другим видам, таким как люди, верблюды и козы, посредством более сильного взаимодействия RBD-ACE2 ( рис. 6 ). Такой «плейотропный эффект» мутаций, вероятно, был вызван структурным сходством ACE2 у разных видов и указывает на то, что как только вариант SARS-CoV-2 приобретает способность заражать нового хозяина, он может накапливать мутации в этом новом животном резервуаре и может передаваться другому виду. Эта «цепная реакция» смены хозяина потенциально может привести к удивительно высокому разнообразию в адаптации к рецептору ACE2 у разных видов хозяев.
Люди представляют собой крупнейший известный резервуар SARS-CoV-2 и часто вступают в контакт с другими животными, включая сельскохозяйственных животных, домашних животных или диких животных, которые вторгаются в дома в поисках пищи и убежища. Учитывая способность SARS-CoV-2 распространяться среди различных видов, вполне вероятно, что глобальные популяции столкнутся с дополнительными вариантами животного происхождения, пока пандемия не будет взята под контроль. Таким образом, наше исследование подчеркивает необходимость наблюдения за вирусами и секвенирования животных, особенно тех, которые находятся в тесном контакте с людьми.
Мое мнение
Теория о появлении варианта Омикрон в мышах, безусловно, заслуживает внимания. Проведена серьезная работа и в пользу этой гипотезы представлен ряд аргументов.
Тут нужно понимать, что даже если мыши к появлению варианта Омикрон и не имели отношения, то, судя по представленным данным – вполне могли бы. И ничего не мешает происходить подобному в будущем.
Желаю всем удачи в Новом Году и с Рождеством Христовым!