ماذا يعني RMSD؟

كيف نقيس استقرار البروتين أو الدواء داخل موقع الارتباط أثناء المحاكاة الجزيئية؟ 🤔
الجواب يكمن في مقياس بسيط لكنه قوي: RMSD (Root Mean Square Deviation) 📈

في هذا الفيديو ستتعرف على:
✅ ما هو RMSD ولماذا يُعد من أهم المؤشرات في النمذجة الجزيئية.
✅ كيف نستخدمه في Docking لقياس دقة الوضعية (Pose) مقارنة بالبنية المرجعية 🧩.
✅ دوره في المحاكاة الجزيئية (MD Simulation) لفهم استقرار البروتين 🧬 واستقرار الدواء داخل موقع الارتباط 💊.
✅ أمثلة عملية على تفسير منحنيات RMSD 📊.

🟢 0:00 – 0:41 : مقدمة تمهيدية عن موضوع الحلقة
🔵 0:42 – 11:10 : مفهوم RMSD و متى نستخدمه
🟣 11:11 – 14:36 : كيفية حساب قيمة ال RMSD لنظام ديناميكي معين
🟠 14:38 – 19:10 : حساب ال RMSD للتاكد من دقة بروتوكول الالتحام
🟡 19:11 – 27:40 : حساب ال RMSD لدراسة استقرار نظام معين اثناء المحاكاة الجزيئية
🟡 27:41 – نهاية الفيديو : طبيعة قيمة ال RMSD كقيمة متوسطة عامة تعطي نظرة عامة عن ديناميكية نظام معين

مشاهدة ممتعة و مفيدة

✉️ تواصل معنا عبر رسائل الصفحة أو عبر الموقع الالكتروني:
https://bioinformatika-egy.com/

#نمذجة
#علم الاحياء الحاسوبي
#صيدلة
#طب
#صحة
#تصميم الادوية
#modelling
#pharmacy
#medicine
#docking
#medicinalchemistry
#science
#pharmacology
#biology

#علم_الأحياء #هندسة_البروتين #البيوفيلم #بكتيريا #البحث_العلمي #تصميم_الأدوية #ProteinEngineering #QuorumSensing #Pseudomonas #PhageProteins #LasR #MDsimulation #DrugDesign #بكتيريوفاج