Simuler l'origine de la vie, systèmes de particules et automates cellulaires - Passe-science #55

Peut-on simuler un phénomène qui soit une analogie pertinente à l'émergence de la vie sur Terre ?Découvrons ensemble ce qu'en disent les automates cellulaires et les systèmes de particules, dont une simulation faite maison!
Avec maintenant une publication associée sur ArXiv: https://arxiv.org/abs/2311.10761

Sommaire:
00:00 Intro
0:42 Rappel: vie et évolution
3:07 CA: émergence de réplicateurs simples
5:37 CA: réplicateurs capables d'évolution - 8:50 CA: émergence de réplicateurs complexes
11:30 Système de particules primordial
14:42 Squirm3
15:57 Vie et autopoïèse
17:33 Mon modèle: règles
19:22 Mon modèle: simulation!
22:29 Mon modèle: évolution
26:19 Remarques et code
27:49 Alien Project!
28:45 Outro

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En lien sur la chaîne:
L'origine de la vie:    • L'origine de la vie, que sait on en 2020 ?...  
L'évolution:    • L'évolution, théorie et simulation informa...  
Sur le monde des nanomachines biologiques:
   • Nanomachines biologiques: SARS-CoV2 et ges...  
   • La physique des nanomachines biologiques -...  

Ma simulation: https://github.com/ThomasCabaret/Simu...

Un autre type de simulation de vie:    • LYFE : la Thermodynamique de la Vie [Astro...  

Alien-Project:
https://alien-project.org/
   / @alien-project  
  / discord  
https://github.com/chrxh/alien

Qu'est ce qu'un automate cellulaire?
   • Le Jeu de la Vie  

Pour explorer les automates cellulaires de la vidéo aller sur:
https://lazyslug.com/lifeviewer/
Coller la règle-pattern (voir ci-dessous) dans la boîte de texte en bas à gauche.
Cliquer sur "view".

Règle pattern pour l'automate cellulaire 1:
x = 5, y = 5, rule = B2kn3-nq5y6i7/S23-aeny4ciknqtz
bo$3o$o$2b2o$2o$bo!

Règle pattern pour l'automate cellulaire 2:
x = 3, y = 4, rule = B2i35j6n7c/S2-i3-a4eit
2o$b2o$2o$o!

Règle pattern pour l'automate cellulaire 3 (2023):
x = 3, y = 3, rule = MAPERETQB4eHWkQ7xD4eYZosBQZFixOBHmtFeehExrKVhURLRAqGxeIlSO1JYZP6DRi69rop7TQCkvWTIag7kAS8g
bo$3o$2bo!

Les exemples 1 et 2 d'automates cellulaires ont été trouvés sur ce forum:
https://conwaylife.com/forums/viewtop...

Publication de 1997 avec l'émergence de boucle de Langton capable d'une forme d'évolution:
http://fab.cba.mit.edu/classes/S62.12...
Le code et les règles sont ici dans un format custom:
https://complexcomputation.org/downlo...

Publication de 2023 avec la règle "Outlier": https://arxiv.org/abs/2305.19504

Squirm3 de Tim Hutton: https://github.com/timhutton/squirm3

Primordial Particle System, PPS:
   • How life emerges from a simple particle mo...  
https://www.nature.com/articles/srep3...

Animations récap bio:
https://www.smart-biology.com/ extraits publiques utilisées avec permission (Andrew Catalano)
https://www.wehi.edu.au/wehi-tv extraits utilisés avec permission (Drew Berry)
https://animationlab.utah.edu/cova extraits utilisés avec permission (Janet Iwasa)

Musique:
Hi-tech corporate - The Right Music for video
https://www.musicscreen.org/Royalty-f...
Enigmatic - Bensound https://www.bensound.com/royalty-free...
Lemmings level 07!:    • Lemmings music - PC (DOS) Level 07 (Builde...  

Youtube Audio Library:
Lonely Troutman II - William Rosati
Frost Waltz - Kevin Macleod
Groove Grove - Kevin Macleod
Brittle Rille - Kevin Macleod
Decisions - Kevin Macleod
Deliberate Thought - Kevin Macleod
Searching For You - White Hex