F-statistiques (5) Fst exemples détaillés
Автор: Bioinformatique et génomique
Загружено: 2023-05-17
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Cette vidéo est la cinquième d’une série de vidéos pédagogiques consacrées aux F-statistiques. Ces indicateurs sont très utilisés en génétique des populations, car ils ont l'avantage d'être simples et de fournir néanmoins des informations précieuses sur les populations étudiées, que ce soit sur leur régime de reproduction, via le Fis ou sur leur éventuelle structuration en sous-populations distinctes, via le Fst.
Cette cinquième vidéo se focalise sur le calcul et l'interprétation du Fst. Plusieurs exemples sont détaillés pour permettre une bonne compréhension de ce que mesure cet indicateur, de la manière dont on peut le calculer et de sa complémentarité avec Fis.
0:00 - intro
0:38 - Fst intuition et interprétation
1:57 - Fst formule (rappel)
2:09 - Exemple 1 : 2 sous populations 2 allèles
4:42 - Exemple 2 (exo) : 2 sous populations 2 allèles
6:08 - Fst et fréquences alléliques/génotypiques
6:53 - Exemple 3 (exo) : complémentarité Fis Fst
10:20 - Evolution des valeurs de Fst en fonction de la divergence entre p1 et p2
12:20 - Exemple 4 (exo) : cas gnénéral 3 sous-population, 3 allèles
18:36 - Conclusion
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