Популярное

Музыка Кино и Анимация Автомобили Животные Спорт Путешествия Игры Юмор

Интересные видео

2025 Сериалы Трейлеры Новости Как сделать Видеоуроки Diy своими руками

Топ запросов

смотреть а4 schoolboy runaway турецкий сериал смотреть мультфильмы эдисон
dTub
Скачать

Fix Missing Atoms in PDB Files Using Swiss PDB Viewer | AutoDock Docking Preparation

Автор: Omixium

Загружено: 2025-08-10

Просмотров: 1015

Описание:

This guide covers the essential steps to fix missing atoms in a PDB (Protein Data Bank) file using Swiss PDB Viewer before proceeding with molecular docking studies in AutoDock. The process is crucial for ensuring the structural integrity of your protein model, as missing atoms can lead to errors in docking simulations. You'll learn how to identify gaps in the structure, add missing atoms or residues, and prepare a corrected PDB file ready for docking analysis. This step-by-step tutorial is ideal for computational chemists, biochemists, and researchers working on molecular docking projects.

#PDBFile #SwissPDBViewer #MolecularDocking #AutoDock #ProteinStructure #ComputationalChemistry #StructuralBiology #DrugDiscovery #Biochemistry #DockingSimulation


==================================================================
Welcome to Omixium!

This channel is dedicated to empowering the next generation of scientists with hands-on tutorials, deep dives, and tool walkthroughs in:

🔬 Bioinformatics & Computational Biology
🧠 AI in Drug Discovery & Protein Design
⚗️ Molecular Docking, MD Simulations & Systems Biology
🧬 Single-cell RNA-seq, Multi-omics & NGS Pipelines
👨‍💻 AI Coding for Biology (Claude, Gemini, GPT)

🧪 New videos every week — for scientists, students, coders, and curious minds!

---

🌐 Stay Connected:

🔗 LinkedIn: [Pritam Kumar Panda](  / pritam-kumar-panda  )
🌍 Website: [https://www.atomodyssey.com](https://www.atomodyssey.com)
📧 Contact: [omixium@gmail.com](mailto:omixium@gmail.com)
💻 GitHub: [https://github.com/pritampanda15](https://github.com/pritampanda15)

Fix Missing Atoms in PDB Files Using Swiss PDB Viewer | AutoDock Docking Preparation

Поделиться в:

Доступные форматы для скачивания:

Скачать видео mp4

  • Информация по загрузке:

Скачать аудио mp3

Похожие видео

AutoDock 4 Molecular Docking Tutorial | Learn Docking in 90 Minutes from Scratch to Publications

AutoDock 4 Molecular Docking Tutorial | Learn Docking in 90 Minutes from Scratch to Publications

Building missing residues in PDB structure as loop regions using PyMol

Building missing residues in PDB structure as loop regions using PyMol

Building an End-to-End ML Pipeline for RNASeq Data (and why it matters)

Building an End-to-End ML Pipeline for RNASeq Data (and why it matters)

Как выполнить молекулярный докинг – Часть 2: Анализ и визуализация результатов с помощью PyRx и D...

Как выполнить молекулярный докинг – Часть 2: Анализ и визуализация результатов с помощью PyRx и D...

Как точно интерпретировать результаты докинга | Учебное пособие по молекулярному докингу

Как точно интерпретировать результаты докинга | Учебное пособие по молекулярному докингу

Protein Structure Visualization using Swiss PDB Viewer #bioinformatics #protein #visualization #pdb

Protein Structure Visualization using Swiss PDB Viewer #bioinformatics #protein #visualization #pdb

Чем ОПАСЕН МАХ? Разбор приложения специалистом по кибер безопасности

Чем ОПАСЕН МАХ? Разбор приложения специалистом по кибер безопасности

Converting AutoDock result to a complex PDB file using Chimera #bioinformatics #pdb #chimera #biogem

Converting AutoDock result to a complex PDB file using Chimera #bioinformatics #pdb #chimera #biogem

Post Docking Analysis in Molecular Docking | Hydrogen Bond, Charge, Hydrophobic & 2D–3D Interactions

Post Docking Analysis in Molecular Docking | Hydrogen Bond, Charge, Hydrophobic & 2D–3D Interactions

AutoDock Vina Redocking | Part 1

AutoDock Vina Redocking | Part 1

LLM и GPT - как работают большие языковые модели? Визуальное введение в трансформеры

LLM и GPT - как работают большие языковые модели? Визуальное введение в трансформеры

Protein Preparation for GROMACS | Easy Forcefield Setup, Ligand Extraction Cleanup & No more Errors!

Protein Preparation for GROMACS | Easy Forcefield Setup, Ligand Extraction Cleanup & No more Errors!

How Scientists Map Genes in 3D Spaces! | Spatial Transcriptomics

How Scientists Map Genes in 3D Spaces! | Spatial Transcriptomics

Molecular Docking Analysis | Autodock Results Analysis | Protein Ligand Int | Pymol | LigPlot Etc.,

Molecular Docking Analysis | Autodock Results Analysis | Protein Ligand Int | Pymol | LigPlot Etc.,

Zinc Metalloprotein Docking using Autodock4 | AutoDock4Zn complete Tutorial | Step-by-Step Guide

Zinc Metalloprotein Docking using Autodock4 | AutoDock4Zn complete Tutorial | Step-by-Step Guide

Анализ и проверка результатов стыковки с помощью Discovery Studio

Анализ и проверка результатов стыковки с помощью Discovery Studio

Homology modelling using SWISS-MODEL web server

Homology modelling using SWISS-MODEL web server

How AI Cracked the Protein Folding Code and Won a Nobel Prize

How AI Cracked the Protein Folding Code and Won a Nobel Prize

Manipulate complex PDB structure in Pymol

Manipulate complex PDB structure in Pymol

How to Find Active Site Dimensions for Docking: Using Discovery Studio and Molegro Virtual Docker

How to Find Active Site Dimensions for Docking: Using Discovery Studio and Molegro Virtual Docker

© 2025 dtub. Все права защищены.



  • Контакты
  • О нас
  • Политика конфиденциальности



Контакты для правообладателей: infodtube@gmail.com