IA générative : impact sur les pratiques et les formations en bioinfo

Depuis plus d'un an, j'utilise régulièrement l'IA générative dans mes activités professionnelles, notamment pour coder plus efficacement. Cette évolution m'a naturellement conduit à adapter les cours de bioinformatique que je donne aux étudiants. Ce séminaire s'appuie sur cette expérience pour détailler l'assistance que des outils comme ChatGPT ou GitHub Copilot peuvent apporter notamment lors de l’écriture de programmes (R, Bash, Python etc.). Dans ce séminaire je ne m'attarde pas sur les mécanismes sous-jacents de ces outils, mais plutôt sur l'utilisation de ces outils pour coder plus efficacement : quels sont les points forts et les limites de ces outils ? comment en tirer le meilleur parti ? La présentation sera structurée en trois parties (de durées inégales) pour présenter l'impact de l'IA sur i) la manière de coder ii) la formation en bioinfo iii) les interactions en bioinfo.

Ce séminaire a été donné dans le cadre des journées IA génératives (11 janv. 2024) du réseau MERIT (Métier en Bioinformatique) puis dans le cadre des séminaires de l'UMR DIADE le 5 mars à l'IRD (l'enregistrement est tiré de ce dernier séminaire).
-00:00: Intro
-05:00: ChatGPT fait une boucle en bash
-11:14: ChatGPT restreint un fichier fastq en awk
-15:00: ChatGPT fait de la genet des pops en R
-21:47: ChatGPT cherche le bug
-25:16: ChatGPT s'embrouille dans ses explication du grep -w
-28:20: Copilot m'écrit un script bash
-31:30: IA et gain de productivité
-33:11: IA et facilité d'apprentissage de la programmation
-35:04: IA, quels impacts sur les compétences à enseigner/posséder ?
-42:37: IA et sécurité
-46:00: IA, quels impact sur les interactions ?
-49:30: les Chatbot à façon, des supers tuteurs !
-55:31: Y a pas que chatGPT dans la vie ...