Популярное

Музыка Кино и Анимация Автомобили Животные Спорт Путешествия Игры Юмор

Интересные видео

2025 Сериалы Трейлеры Новости Как сделать Видеоуроки Diy своими руками

Топ запросов

смотреть а4 schoolboy runaway турецкий сериал смотреть мультфильмы эдисон
dTub
Скачать

FASTQ Quality Check using FastQC | RNA-Seq Data Preprocessing | Ep. 31

Автор: Bioinfocamp

Загружено: 2025-06-11

Просмотров: 19

Описание:

Welcome to Lecture 31 of the Bioinformatics Data Analysis using Linux, Python & R series!
In this session, we perform quality control (QC) of raw FASTQ files using FastQC, an essential first step in any RNA-Seq or NGS pipeline.

🔬 What You’ll Learn:
What is FastQC and why it’s important for RNA-Seq

How to install and run FastQC on FASTQ files (Linux/Windows)

Understanding the FastQC HTML reports:

Per base quality

GC content

Adapter content

Overrepresented sequences

How to interpret warning or fail flags

Best practices for deciding if trimming is needed

After this lecture, you'll be able to confidently check and interpret the quality of your RNA-Seq or NGS data before proceeding to alignment or quantification.

📂 Sample data + FastQC output example: https://bioinfocamp.co
📺 Full course playlist: [Series Playlist Link]
💬 Ask questions in the comments or join our support group: [Discord/FB Group Link]

👍 Like | 💬 Share your FastQC results | 🔔 Subscribe to follow the full RNA-Seq pipeline!

#fastqc
#rnaseq
#ngsdata
#bioinformatics
#qualitycontrol
#fastq
#linuxpythonr
#transcriptomics
#biostatistics
#genomics

FASTQ Quality Check using FastQC | RNA-Seq Data Preprocessing | Ep. 31

Поделиться в:

Доступные форматы для скачивания:

Скачать видео mp4

  • Информация по загрузке:

Скачать аудио mp3

Похожие видео

array(10) { [0]=> object(stdClass)#4809 (5) { ["video_id"]=> int(9999999) ["related_video_id"]=> string(11) "AFy5JrffrFc" ["related_video_title"]=> string(81) "Download FASTQ Files from NCBI SRA | RNA-Seq Data Retrieval Step-by-Step | Ep. 30" ["posted_time"]=> string(22) "10 дней назад" ["channelName"]=> string(11) "Bioinfocamp" } [1]=> object(stdClass)#4782 (5) { ["video_id"]=> int(9999999) ["related_video_id"]=> string(11) "22tkx79icy4" ["related_video_title"]=> string(55) "RAG | САМОЕ ПОНЯТНОЕ ОБЪЯСНЕНИЕ!" ["posted_time"]=> string(23) "1 месяц назад" ["channelName"]=> string(8) "AI RANEZ" } [2]=> object(stdClass)#4807 (5) { ["video_id"]=> int(9999999) ["related_video_id"]=> string(11) "lG11JjovJHE" ["related_video_title"]=> string(84) "Setup RNA-Seq Pipeline from scratch: fastq (reads) to counts | Step-by-Step Tutorial" ["posted_time"]=> string(21) "3 года назад" ["channelName"]=> string(16) "Bioinformagician" } [3]=> object(stdClass)#4814 (5) { ["video_id"]=> int(9999999) ["related_video_id"]=> string(11) "H1EyiGPZwwc" ["related_video_title"]=> string(92) "ВЕКТОРНЫЕ БАЗЫ ДАННЫХ - САМОЕ ПОНЯТНОЕ ОБЪЯСНЕНИЕ!" ["posted_time"]=> string(19) "3 дня назад" ["channelName"]=> string(8) "AI RANEZ" } [4]=> object(stdClass)#4793 (5) { ["video_id"]=> int(9999999) ["related_video_id"]=> string(11) "D4HPBwNj37w" ["related_video_title"]=> string(69) "RNA-Seq Read Alignment using Bowtie2 | Align FASTQ to Genome | Ep. 33" ["posted_time"]=> string(21) "8 дней назад" ["channelName"]=> string(11) "Bioinfocamp" } [5]=> object(stdClass)#4811 (5) { ["video_id"]=> int(9999999) ["related_video_id"]=> string(11) "JcShOFSoY1o" ["related_video_title"]=> string(100) "How I Accidentally Built a Synthetic Data Generator & Validator App With Self Correcting AI Loop" ["posted_time"]=> string(23) "5 часов назад" ["channelName"]=> string(13) "Abhishek Jain" } [6]=> object(stdClass)#4806 (5) { ["video_id"]=> int(9999999) ["related_video_id"]=> string(11) "fsSs7QJq0cU" ["related_video_title"]=> string(178) "Иран нанес самый мощный ракетный удар по Израилю – Тель-Авив объявляет чрезвычайное положение" ["posted_time"]=> string(24) "10 часов назад" ["channelName"]=> string(20) "JET TEMPUR INDONESIA" } [7]=> object(stdClass)#4816 (5) { ["video_id"]=> int(9999999) ["related_video_id"]=> string(11) "95Mkwbsk2HQ" ["related_video_title"]=> string(79) "Можно ли поменять родину так быстро? / вДудь" ["posted_time"]=> string(19) "2 дня назад" ["channelName"]=> string(10) "вДудь" } [8]=> object(stdClass)#4792 (5) { ["video_id"]=> int(9999999) ["related_video_id"]=> string(11) "rp_unAZHcVo" ["related_video_title"]=> string(115) "Шокирующее заявление президента / Выставлен резкий ультиматум" ["posted_time"]=> string(23) "8 часов назад" ["channelName"]=> string(10) "NEXTA Live" } [9]=> object(stdClass)#4810 (5) { ["video_id"]=> int(9999999) ["related_video_id"]=> string(11) "0vyNFQmampw" ["related_video_title"]=> string(125) "КАК ИСПРАВИТЬ ЗРЕНИЕ? Офтальмолог №1 про упражнения, операции и БАДы" ["posted_time"]=> string(25) "4 недели назад" ["channelName"]=> string(23) "Глеб Соломин" } }
Download FASTQ Files from NCBI SRA | RNA-Seq Data Retrieval Step-by-Step | Ep. 30

Download FASTQ Files from NCBI SRA | RNA-Seq Data Retrieval Step-by-Step | Ep. 30

RAG | САМОЕ ПОНЯТНОЕ ОБЪЯСНЕНИЕ!

RAG | САМОЕ ПОНЯТНОЕ ОБЪЯСНЕНИЕ!

Setup RNA-Seq Pipeline from scratch: fastq (reads) to counts | Step-by-Step Tutorial

Setup RNA-Seq Pipeline from scratch: fastq (reads) to counts | Step-by-Step Tutorial

ВЕКТОРНЫЕ БАЗЫ ДАННЫХ - САМОЕ ПОНЯТНОЕ ОБЪЯСНЕНИЕ!

ВЕКТОРНЫЕ БАЗЫ ДАННЫХ - САМОЕ ПОНЯТНОЕ ОБЪЯСНЕНИЕ!

RNA-Seq Read Alignment using Bowtie2 | Align FASTQ to Genome | Ep. 33

RNA-Seq Read Alignment using Bowtie2 | Align FASTQ to Genome | Ep. 33

How I Accidentally Built a Synthetic Data Generator & Validator App With Self Correcting AI Loop

How I Accidentally Built a Synthetic Data Generator & Validator App With Self Correcting AI Loop

Иран нанес самый мощный ракетный удар по Израилю – Тель-Авив объявляет чрезвычайное положение

Иран нанес самый мощный ракетный удар по Израилю – Тель-Авив объявляет чрезвычайное положение

Можно ли поменять родину так быстро? / вДудь

Можно ли поменять родину так быстро? / вДудь

Шокирующее заявление президента / Выставлен резкий ультиматум

Шокирующее заявление президента / Выставлен резкий ультиматум

КАК ИСПРАВИТЬ ЗРЕНИЕ? Офтальмолог №1 про упражнения, операции и БАДы

КАК ИСПРАВИТЬ ЗРЕНИЕ? Офтальмолог №1 про упражнения, операции и БАДы

© 2025 dtub. Все права защищены.



  • Контакты
  • О нас
  • Политика конфиденциальности



Контакты для правообладателей: [email protected]