Популярное

Музыка Кино и Анимация Автомобили Животные Спорт Путешествия Игры Юмор

Интересные видео

2025 Сериалы Трейлеры Новости Как сделать Видеоуроки Diy своими руками

Топ запросов

смотреть а4 schoolboy runaway турецкий сериал смотреть мультфильмы эдисон
dTub
Скачать

Estimation of relative abundance of species in metagenome data 2 of 3 | bracken and tables merging

Автор: R&Omics

Загружено: 2024-03-09

Просмотров: 876

Описание:

Metagenomics tutorial
Complete pipeline for estimating the relative abundance of microbial species using kraken and bracken, starting from paired end fastq files

Github repository:
https://github.com/malina-dva/Estimat...

kranek2 and braken indexes:
https://benlangmead.github.io/aws-ind...

Chapters
00:00 Intro
03:07 Run bracken
04:30 Explore bracken output
08:00 Merge the outputs from bracken utilizing a python script

Disclaimer: "The views and opinions expressed in these tutorials are my own and do not reflect the views and opinions of my previous or current employers."

#kraken #bracken #linux #python #relativeabundance #kraken2 #taxpasta #metagenome #sequencing
#bioinformatics #bioinformática #bioinformaticsforbeginners #genome #genomics #genomesequencing #datascience #metagenomics #linuxforbeginners #kraken #bracken #linux #python #relativeabundance #kraken2

Estimation of relative abundance of species in metagenome data  2 of 3 | bracken and tables merging

Поделиться в:

Доступные форматы для скачивания:

Скачать видео mp4

  • Информация по загрузке:

Скачать аудио mp3

Похожие видео

Estimation of relative abundance of species in metagenome data 3 of 3 | full taxa lineage (taxpasta)

Estimation of relative abundance of species in metagenome data 3 of 3 | full taxa lineage (taxpasta)

Estimation of relative abundance of species in metagenome data 1 of 3 | Set up and kraken2 run

Estimation of relative abundance of species in metagenome data 1 of 3 | Set up and kraken2 run

Vibe Coding: создание обучающей игры

Vibe Coding: создание обучающей игры

Metagenomic Sequence Classification wth KRAKEN | 16s rna microbial analysis of nanopore data

Metagenomic Sequence Classification wth KRAKEN | 16s rna microbial analysis of nanopore data

Metagenomic Sequence Classification using KRAKEN | Episode 1 | Metagenomics tutorial

Metagenomic Sequence Classification using KRAKEN | Episode 1 | Metagenomics tutorial

Анализ микробиома в R с использованием Phyloseq (QIIME) | Биоинформатика для начинающих

Анализ микробиома в R с использованием Phyloseq (QIIME) | Биоинформатика для начинающих

Экспресс-курс RAG для начинающих

Экспресс-курс RAG для начинающих

LLM и GPT - как работают большие языковые модели? Визуальное введение в трансформеры

LLM и GPT - как работают большие языковые модели? Визуальное введение в трансформеры

Музыка для работы за компьютером | Фоновая музыка для концентрации и продуктивности

Музыка для работы за компьютером | Фоновая музыка для концентрации и продуктивности

🧑‍💻 Собеседования и найм: алгоритмы, высокие нагрузки, использование LLM, IDE, стресс и лайвкодинг

🧑‍💻 Собеседования и найм: алгоритмы, высокие нагрузки, использование LLM, IDE, стресс и лайвкодинг

Лучший Гайд по Kafka для Начинающих За 1 Час

Лучший Гайд по Kafka для Начинающих За 1 Час

ДНК создал Бог? Самые свежие научные данные о строении. Как работает информация для жизни организмов

ДНК создал Бог? Самые свежие научные данные о строении. Как работает информация для жизни организмов

4 часа Шопена для обучения, концентрации и релаксации

4 часа Шопена для обучения, концентрации и релаксации

Предел развития НЕЙРОСЕТЕЙ

Предел развития НЕЙРОСЕТЕЙ

GraphRAG: союз графов знаний и RAG: Эмиль Эйфрем

GraphRAG: союз графов знаний и RAG: Эмиль Эйфрем

Почему римский БЕТОН прослужит 2000 лет, а наш — умрёт через 50 лет

Почему римский БЕТОН прослужит 2000 лет, а наш — умрёт через 50 лет

Как устроена База Данных? Кластеры, индексы, схемы, ограничения

Как устроена База Данных? Кластеры, индексы, схемы, ограничения

CLIMB Workshop - 3   Kraken classification of short reads

CLIMB Workshop - 3 Kraken classification of short reads

Визуализация внимания, сердце трансформера | Глава 6, Глубокое обучение

Визуализация внимания, сердце трансформера | Глава 6, Глубокое обучение

Градиентный спуск, как обучаются нейросети | Глава 2, Глубинное обучение

Градиентный спуск, как обучаются нейросети | Глава 2, Глубинное обучение

© 2025 dtub. Все права защищены.



  • Контакты
  • О нас
  • Политика конфиденциальности



Контакты для правообладателей: [email protected]