Популярное

Музыка Кино и Анимация Автомобили Животные Спорт Путешествия Игры Юмор

Интересные видео

2025 Сериалы Трейлеры Новости Как сделать Видеоуроки Diy своими руками

Топ запросов

смотреть а4 schoolboy runaway турецкий сериал смотреть мультфильмы эдисон
dTub
Скачать

Genome Assembly Tutorial - Nanopore LONG READS(ONT) with Flye | Bioinformatics - Beginner Level

Автор: Bioinformatics Coach

Загружено: 2021-11-13

Просмотров: 10389

Описание:

Genome assembly of oxford nanopore reads(ONT) using Flye
Download the codes for this material here:

Consultation(Video Conferencing): https://calendly.com/bioinformaticscoach
Teaching(Video Conferencing): https://calendly.com/bioinformaticscoach
Consultation(Audio Call): https://clarity.fm/vincentappiah

Get more bioinformatics tutorials on Patreon:   / bigdataanalytics  

Support my work
https://www.buymeacoffee.com/informat...
https://www.paypal.com/paypalme/thein...
  / bigdataanalytics  

Subscribe to my channels
Bioinformatics:    / @bioinformaticscoach  
Data Science:    / @datasciencecoach  
Short Clips:    / @bioinformaticscforbeginners  

Reach out
bioinformaticscoach@gmail.com

Software installation instructions

Install Anaconda in Linux
   • Install , Configure and Run Anaconda in  a...  
Flye
https://github.com/fenderglass/Flye
Porechop
https://github.com/rrwick/Porechop#bu...

Where to search and download the data
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/sra
Article from which the data was obtained
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/arti...





Sections of the video
00:00 Introduction
00:21 Overview of the tutorial
01:01 PC Requirement
02:22 Source of data for this tutorial
02:49 Download the data
06:39 Installing the tools for this tutorial
10:56 Trimming the data
14:45 Assemble the reads using flye
19:44 Explore the output files
23:33 Post-Genome Assembly Analysis




LONG READ (ONT) Genome Assembly Tutorial with Flye | Bioinformatics 101 for Beginners
How I perform Genome Assembly on ONT reads using Flye | Bioinformatics for Beginners



genome assembly spades,
genome assembly,
genome assembly tutorial,
genome assembly and annotation,
genome annotation,
genome assembly bioinformatics,
genome assembly process,
genome assembly galaxy,
genome assembly and annotation pipeline,
genome assembly programming challenge,
genome sequencing vs alignment,bioinformatics,linux for bioinformatics


#bioinformatics #bioinformaticsforbeginners #genome #genomesequencing #genomics #linuxforbeginners #bioinformática

Genome Assembly Tutorial  -  Nanopore LONG READS(ONT) with  Flye |  Bioinformatics - Beginner Level

Поделиться в:

Доступные форматы для скачивания:

Скачать видео mp4

  • Информация по загрузке:

Скачать аудио mp3

Похожие видео

Variant Calling using BCFTOOLS  | BCFTOOLS Tutorial | Germline variant calling

Variant Calling using BCFTOOLS | BCFTOOLS Tutorial | Germline variant calling

Microbiome/Metagenome Analysis Workshop: DADA2

Microbiome/Metagenome Analysis Workshop: DADA2

Что такое чтения, контиги и скаффолд?

Что такое чтения, контиги и скаффолд?

Best Practices for Rapid Reference Quality Genome Assembly - Webinar

Best Practices for Rapid Reference Quality Genome Assembly - Webinar

Биоинформатика для трехмерного генома: Введение в анализ и интерпретацию данных Hi-C

Биоинформатика для трехмерного генома: Введение в анализ и интерпретацию данных Hi-C

Flye и metaFlye: алгоритмы для сборки длинных фрагментов de novo с использованием графов повторов

Flye и metaFlye: алгоритмы для сборки длинных фрагментов de novo с использованием графов повторов

5 форматов геномных файлов, которые вы должны знать

5 форматов геномных файлов, которые вы должны знать

Сборка генома — Обзор. Часть 1.

Сборка генома — Обзор. Часть 1.

Bioinformatics - Understanding Trimmomatic

Bioinformatics - Understanding Trimmomatic

ONT bioinformatics part 1: introduction

ONT bioinformatics part 1: introduction

How to install the Genome Assembly tool spades in any Linux  Machine using binaries

How to install the Genome Assembly tool spades in any Linux Machine using binaries

Metagenomics Assembly using Megahit

Metagenomics Assembly using Megahit

Bioinformatics Analysis of methicilin-resistant Bacterial strain using nanopore data

Bioinformatics Analysis of methicilin-resistant Bacterial strain using nanopore data

Setup RNA-Seq Pipeline from scratch: fastq (reads) to counts | Step-by-Step Tutorial

Setup RNA-Seq Pipeline from scratch: fastq (reads) to counts | Step-by-Step Tutorial

Основы DESeq2 | Анализ дифференциальной экспрессии генов | Биоинформатика 101

Основы DESeq2 | Анализ дифференциальной экспрессии генов | Биоинформатика 101

How to use Singularity for Bioinformatics

How to use Singularity for Bioinformatics

Introduction to Metagenomics for Researchers

Introduction to Metagenomics for Researchers

Mikhael Kolmogorov - Flye

Mikhael Kolmogorov - Flye

Bioinformatics - Assembling, Annotating, and QA for Bacterial Genomes!

Bioinformatics - Assembling, Annotating, and QA for Bacterial Genomes!

Metagenomic Sequence Classification using KRAKEN | Episode 1 | Metagenomics tutorial

Metagenomic Sequence Classification using KRAKEN | Episode 1 | Metagenomics tutorial

© 2025 dtub. Все права защищены.



  • Контакты
  • О нас
  • Политика конфиденциальности



Контакты для правообладателей: infodtube@gmail.com