Introduction to scRNA-seq data analysis and interpretation using Seurat

Автор: dfcidatascience

Загружено: 2024-03-21

Просмотров: 1140

Описание:

Yujie Guo, research assistant in Dr. Heng Li's lab. She's working on cancer genome assembly.

Seurat is an R package designed for QC, analysis, and exploration of single-cell RNA-seq data. It has been widely used in both dry lab and wet lab settings for its robustness and scalability. In this coding workshop, we will demonstrate the workflow of Seurat, use published matched tumor-normal data, and have hands-on experience of analyzing and interpreting such information.

Moduled Scripts: https://github.com/magspho/DS_seurat_...

Our #DataScience Training Sessions offer hands-on training in #statistics, #computationalbiology and #machinelearning by experts at the Department of Data Science at Dana-Farber Cancer Institute.

Introduction to scRNA-seq data analysis and interpretation using Seurat

Доступные форматы для скачивания:

Скачать видео mp4

Информация по загрузке:

Скачать аудио mp3

Похожие видео

DFCI – Data Science Centralized Data Access and Sharing

DFCI – Data Science Centralized Data Access and Sharing

Standard scRNAseq preprocessing workflow with Seurat | Beginner R

Standard scRNAseq preprocessing workflow with Seurat | Beginner R

6. Dimensionality reduction of scRNA-seq data

6. Dimensionality reduction of scRNA-seq data

Complete single-cell RNAseq analysis walkthrough | Advanced introduction

Complete single-cell RNAseq analysis walkthrough | Advanced introduction

Гренландия: остров китов, нищеты и алкоголизма | Интервью с местными, снег, лед и хаски

Гренландия: остров китов, нищеты и алкоголизма | Интервью с местными, снег, лед и хаски

Efficient Phase I Clinical Trial Design - Fangxing Hong, PhD

Efficient Phase I Clinical Trial Design - Fangxing Hong, PhD

Kelly Street: “Analysis of Single Cell T-Cell Receptor Sequencing”

Kelly Street: “Analysis of Single Cell T-Cell Receptor Sequencing”

Single cell transcriptomics - Cell type annotation (7 of 10)

Single cell transcriptomics - Cell type annotation (7 of 10)

4 Hours Chopin for Studying, Concentration & Relaxation

4 Hours Chopin for Studying, Concentration & Relaxation

scRNA-seq analysis workshop - April 27th, 2020

scRNA-seq analysis workshop - April 27th, 2020

6 упражнений, которые ЯПОНЦЫ делают, чтобы УДВОИТЬ СИЛУ НОГ после 60 🦵🚀

6 упражнений, которые ЯПОНЦЫ делают, чтобы УДВОИТЬ СИЛУ НОГ после 60 🦵🚀

Важные открытия XXI века: почему рак победил и что не так с клонированием? Что скрывают нобелевки?

Важные открытия XXI века: почему рак победил и что не так с клонированием? Что скрывают нобелевки?

Анализ одиночных клеток RNA-Seq в R с помощью Seurat | Биоинформатика для начинающих

Анализ одиночных клеток RNA-Seq в R с помощью Seurat | Биоинформатика для начинающих

t-SNE Cluster Labeling | scRNA-Seq Analysis in Seurat

t-SNE Cluster Labeling | scRNA-Seq Analysis in Seurat

W20: Single Cell RNA-seq with R – Day 1

W20: Single Cell RNA-seq with R – Day 1

Normalization methods for single-cell RNA-Seq data (high-level overview)

Normalization methods for single-cell RNA-Seq data (high-level overview)

Plots vs. Figures: Best Practices for Representing and Presenting Complex Biological Data

Plots vs. Figures: Best Practices for Representing and Presenting Complex Biological Data

Как анализировать данные по экспрессии генов онлайн | GEO2R | Генная экспрессия Omnibus |

Как анализировать данные по экспрессии генов онлайн | GEO2R | Генная экспрессия Omnibus |

Открытие Варбурга: 4 переключателя, которые мешают раку расти | Здоровье с Доктором

Открытие Варбурга: 4 переключателя, которые мешают раку расти | Здоровье с Доктором

Как вылечить БЕЗ операций Близорукость,Дальнозоркость,Астигматизм,Косоглазие.Упражнения проф.Жданова

Как вылечить БЕЗ операций Близорукость,Дальнозоркость,Астигматизм,Косоглазие.Упражнения проф.Жданова