Анализ дифференциальной экспрессии генов в R с DESeq2

Анализ дифференциальной экспрессии генов в R с DESeq2

Title:
Differential Gene Expression Analysis in R with DESeq2 | Bioinformatics for Beginners | Анализ дифференциальной экспрессии генов в R с DESeq2

Description:
Добро пожаловать в наш подробный учебник по анализу дифференциальной экспрессии генов с использованием R и DESeq2 для данных RNA-seq! В этом видео мы проведем вас через весь процесс — от предварительной обработки данных до продвинутых методов визуализации.

🔍 Вы узнаете:
1️⃣ Импорт и предварительная обработка данных: Загрузите данные RNA-seq в R и выполните базовую обработку для подготовки данных к анализу.
2️⃣ MA-график: Создайте MA-графики для визуализации распределения значений экспрессии генов и выявления дифференциально экспрессируемых генов.
3️⃣ Диаграмма дисперсии: Оцените изменчивость экспрессии генов между образцами, чтобы гарантировать надежность анализа.
4️⃣ Анализ главных компонент (PCA): Снизьте размерность данных, выявите скрытые закономерности, определите выбросы и кластеры.
5️⃣ Вулкан-график (Volcano Plot): Визуализируйте значимые дифференциально экспрессируемые гены, контролируя ложноположительные результаты.
6️⃣ Тепловая карта (Heatmap): Визуализируйте шаблоны экспрессии генов по образцам и кластерам для анализа ко-экспрессии и функционального обогащения.

Hashtags (Russian + English):
#mrbioinformatix #bioinformatics #DESeq2 #анализ_экспрессии_генов #differentialgeneexpressionanalysis #normalization #rna #ncbi #genomics #bioinformaticsforbeginners #tutorial #howto #omics #research #ngs #geneexpression #dna #dnasequencing

Ссылки:
DESeq2 Vignette: http://bioconductor.org/packages/deve...

Подписывайтесь:

TikTok:   / mrbioinformatix  

Instagram:   / mr.bioinformatix_