Популярное

Музыка Кино и Анимация Автомобили Животные Спорт Путешествия Игры Юмор

Интересные видео

2025 Сериалы Трейлеры Новости Как сделать Видеоуроки Diy своими руками

Топ запросов

смотреть а4 schoolboy runaway турецкий сериал смотреть мультфильмы эдисон
dTub
Скачать

Single-cell pseudotime and gene regulatory analysis with CellOracle

Автор: Sanbomics

Загружено: 2023-12-18

Просмотров: 7585

Описание:

CellOracle is a powerful suite of tools that can perform pseudotime analysis, gene regulatory network analysis, and in silico perturbation analysis on single-cell data in python. This is a simple tutorial covering the basics of CellOracle while analyzing a developmental pancreas dataset.

Notebook:
https://github.com/mousepixels/sanbom...

Reference:
https://www.nature.com/articles/s4158...


0:00 Intro
1:07 Prepare
4:15 Pseudotime
8:56 Regulatory
14:20 Perturbation
20:22 Conclusions

Single-cell pseudotime and gene regulatory analysis with CellOracle

Поделиться в:

Доступные форматы для скачивания:

Скачать видео mp4

  • Информация по загрузке:

Скачать аудио mp3

Похожие видео

Single-cell iterative preprocessing. Don't throw away real cells!

Single-cell iterative preprocessing. Don't throw away real cells!

Почему простые числа образуют эти спирали? | Теорема Дирихле и пи-аппроксимации

Почему простые числа образуют эти спирали? | Теорема Дирихле и пи-аппроксимации

Анализ траектории отдельной клетки с использованием Monocle3 и Seurat | Пошаговое руководство

Анализ траектории отдельной клетки с использованием Monocle3 и Seurat | Пошаговое руководство

Single-cell trajectory and pseudotime analysis with Monocle3 and Seurat in R

Single-cell trajectory and pseudotime analysis with Monocle3 and Seurat in R

Doing Differential Expression analysis on Proteomics Data using Limpa!!

Doing Differential Expression analysis on Proteomics Data using Limpa!!

CellOracle Workshop: Part 1

CellOracle Workshop: Part 1

Как производятся микрочипы? 🖥️🛠️ Этапы производства процессоров

Как производятся микрочипы? 🖥️🛠️ Этапы производства процессоров

LLM и GPT - как работают большие языковые модели? Визуальное введение в трансформеры

LLM и GPT - как работают большие языковые модели? Визуальное введение в трансформеры

MIA: Morris Lab, Dissecting cell identity via network inference and in silico gene perturbation

MIA: Morris Lab, Dissecting cell identity via network inference and in silico gene perturbation

Comprehensive Integration of Single Cell Data—Rahul Satija

Comprehensive Integration of Single Cell Data—Rahul Satija

Но что такое нейронная сеть? | Глава 1. Глубокое обучение

Но что такое нейронная сеть? | Глава 1. Глубокое обучение

Как Перельман доказал гипотезу Пуанкаре? // 900 секунд

Как Перельман доказал гипотезу Пуанкаре? // 900 секунд

Sushmita Roy | Inference of Gene Regulatory Networks from bulk and single cell omic ... | CGSI 2022

Sushmita Roy | Inference of Gene Regulatory Networks from bulk and single cell omic ... | CGSI 2022

Краткое объяснение больших языковых моделей

Краткое объяснение больших языковых моделей

How to do single-cell RNA velocity analysis | Complete introduction

How to do single-cell RNA velocity analysis | Complete introduction

Введение в анализ данных пространственного секвенирования

Введение в анализ данных пространственного секвенирования

Градиентный спуск, как обучаются нейросети | Глава 2, Глубинное обучение

Градиентный спуск, как обучаются нейросети | Глава 2, Глубинное обучение

Валерий Ширяев о скором (?!) конце войны

Валерий Ширяев о скором (?!) конце войны

1st scanpy session - overview and experimental considerations

1st scanpy session - overview and experimental considerations

2024 updated single-cell guide - Part 1: RNA preprocessing and quality control

2024 updated single-cell guide - Part 1: RNA preprocessing and quality control

© 2025 dtub. Все права защищены.



  • Контакты
  • О нас
  • Политика конфиденциальности



Контакты для правообладателей: [email protected]